《达尔文的疑问》第六十九节

分子证据显示，主要动物种系早在寒武纪之前约6.3亿年就已出现，早于化石记录的爆发，这得益于分子钟的推算。

分子证据显示，主要动物种系早在寒武纪之前约6.3亿年就已出现，早于化石记录的爆发，这得益于分子钟的推算。但分子数据与形态学证据在构建系统发育树时屡屡冲突：昆虫与多足类或甲壳类的亲缘关系、叶口蝠科的进化关系等都存在矛盾，甲壳动物的分类至今未有共识。进化生物学家试图用趋同进化、基因水平转移、长枝吸引效应等解释这些冲突，但这些解释仍无法说明相似特征的来源。此外，间断平衡理论也被用来解释系统发育的矛盾，即进化过快导致关键分子标记无法积累，从而产生冲突的进化树。