《达尔文的疑问》第三十八节

本节从三方面反驳外显子重排假说：其一，现存基因的外显子边界与蛋白质折叠域边界并不对应，若无对应关系则该假说无法解释蛋白质复合结构的起源；其二，从生理学上看……

本节从三方面反驳外显子重排假说：其一，现存基因的外显子边界与蛋白质折叠域边界并不对应，若无对应关系则该假说无法解释蛋白质复合结构的起源；其二，从生理学上看，较小的二级结构单元难以拼凑出新的稳定折叠，因为折叠的稳定性依赖于侧链之间高度特异的相互作用，随意拼接会受侧链干扰，而功能折叠序列在序列空间中极为罕见；其三，该假说回避了“组合通胀”问题——形成一个稳定折叠往往需要上百个精确排序的氨基酸，而中等长度蛋白质的可能性序列多达10的77次方，从中找到功能序列如同大海捞针，随机突变或外显子重排均无力解决。

作者进而批评外显子重排的鼓吹者未提供数学论证或实验证据，只是用“语词杂拌”式的含混术语（如“被招募”“趋同进化”“从头起源”等）描述未观测的过去事件，模糊了理论与证据的界限。作者指出，进化生物学家至今未证实新遗传信息如何产生、未解决组合通胀问题，也未反驳阿克斯对功能基因稀有性的评估。最后作者预告，下一章将讨论新达尔文主义的数学模型及其因果充分性所面临的挑战，并引出生物学家汤姆·弗拉泽塔对渐进式进化机制的理解。