《达尔文的疑问》第四十七节

本节反驳“以基因为中心”的观点，认为遗传信息不足以解释生物结构的空间位置和形式起源。

本节反驳“以基因为中心”的观点，认为遗传信息不足以解释生物结构的空间位置和形式起源。细胞表面的糖分子不由基因产物直接生成，其位置随细胞膜由亲代直接传给子代；胚胎发育中的膜靶点、钠钾离子泵的位置分布也不由编码其蛋白质的基因决定；微管阵列的结构除蛋白质亚基外，还取决于细胞膜内表面的靶点位置和中心体，而中心粒能将整体结构形式直接传给子代。纤毛虫的显微手术可在不改变DNA的情况下产生遗传性改变，说明形式可由亲代三维结构直接传递。因此，子代形态是基因产物与既有三维结构共同作用的结果，基因产物只是必要条件而非充分条件。

关于表观遗传突变能否产生进化创新，作者指出：表观遗传信息所在的结构远大于单个核苷酸，对辐射、化学剂等诱变因素不敏感；即使这些结构被改变，后果也多为胚胎死亡或不育，因为形态发生蛋白、Hox基因调节蛋白和发育基因调控网络的功能都依赖预先存在的特定细胞结构位置，破坏它们会中断发育。

最后，作者指出达尔文当年视为小异常的寒武纪大爆发，如今成为新达尔文理论的重大难题。微进化能解释白桦尺蛾着色、细菌耐药、雀喙变化等小变异，却无法解释爬行动物变哺乳动物等大规模形态转变。多位生物学家（如斯图尔特·汤姆森、米克洛什、吉尔伯特等）均质疑新达尔文机制能否解释新躯体模式的起源。康威·莫里斯2009年也撰文认为寒武纪大爆发的悬案开启了后达尔文主义世界，因为现有证据既解释了化石记录真相，也反驳了新达尔文机制能解释新形式与新信息起源的论点。