《达尔文的疑问》第二十三节

自1859年以来，动物门一级的系统发育分析始终没有得出一致结论，基于解剖和分子数据构建的动物生命树互相矛盾。

自1859年以来，动物门一级的系统发育分析始终没有得出一致结论，基于解剖和分子数据构建的动物生命树互相矛盾。作者指出，如果动物确实源自共同祖先，真实的历史证据理应趋向同一棵树；但各类证据不断生成新的、冲突的进化史。趋同进化（不同生物在相似环境下独立演化出相似特征）进一步动摇了“相似即同源”的推断逻辑，使系统发育重建的假设难以成立。作者以“家族团聚”作类比：若聚会者确为亲戚，交谈越多越应显现出连贯一致的亲缘关系，而实际证据却零散不一，这使共同祖先假说面临压力。由于基因和解剖证据未能补足化石记录中前寒武纪祖先的缺失，问题重新回到化石本身。1968年，古生物学家奈尔斯·埃尔德雷奇在洗衣店检查三叶虫化石时发现物种长期形态不变，他与史蒂芬·杰·古尔德将这种“停滞”视为关键模式，并据此在1972—1980年间提出“间断平衡”理论，否定渐进式进化。